Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms