Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms