Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms