Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OPALINQ96PE5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms