Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35E1Q96K37 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms