Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6Q795 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6Q795 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6Q795 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6Q795 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms