Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms