Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LACTB2Q53H82 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms