Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK3Q15120 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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