Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNB1Q14721 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms