Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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ITGA9Q13797 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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ITGA9Q13797 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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ITGA9Q13797 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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ITGA9Q13797 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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ITGA9Q13797 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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ITGA9Q13797 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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