Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNW1Q13573 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms