Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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