Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms