Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms