Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPCAP84074 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPCAP84074 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPCAP84074 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPCAP84074 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPCAP84074 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms