Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms