Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGFR3P22607 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms