Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms