Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSP16219 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACADSP16219 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSP16219 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms