Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms