Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX3O75364 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX3O75364 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX3O75364 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX3O75364 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX3O75364 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX3O75364 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX3O75364 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms