Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms