Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms