Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms