Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 AL022345.3-201ENST00000611406 228 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 AC018554.3-201ENST00000614215 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR3150A-201ENST00000636546 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 MCFD2-207ENST00000409913 3975 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC87-201ENST00000333861 2908 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ZBTB24-201ENST00000230122 5519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 EFHB-201ENST00000295824 2823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 MEIS2-203ENST00000340545 3056 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 GRIK3-202ENST00000373093 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF574-204ENST00000600245 3598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 NUTM1-204ENST00000614490 4196 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 MPO-201ENST00000225275 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CYB561A3-202ENST00000426130 3205 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 PLK4-201ENST00000270861 3841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 MBTPS2-202ENST00000379484 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP2B3-205ENST00000393842 4064 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ACAD10-203ENST00000455480 4071 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 TCERG1-201ENST00000296702 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 MIGA1-201ENST00000370791 5288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ABCC8-202ENST00000389817 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 SCN5A-206ENST00000425664 8450 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 TSGA10-203ENST00000393483 3878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 SYNE1-237ENST00000539504 3768 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 PMEPA1-203ENST00000347215 4546 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF4-201ENST00000326016 3666 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM32-201ENST00000373983 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 NDUFAF5-202ENST00000378106 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM86EP-201ENST00000313946 2845 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 MSRB3-201ENST00000308259 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ESR1-202ENST00000338799 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ETFB-202ENST00000354232 3551 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF263-201ENST00000219069 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF185-209ENST00000449285 4328 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRC15-202ENST00000428839 3248 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms