Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SERP1Q9Y6X1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SERP1Q9Y6X1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SERP1Q9Y6X1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SERP1Q9Y6X1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SERP1Q9Y6X1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SERP1Q9Y6X1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SERP1Q9Y6X1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SERP1Q9Y6X1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SERP1Q9Y6X1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms