Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXBP1Q9Y5B6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms