Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms