Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms