Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYRM2Q9NU23 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms