Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms