Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms