Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms