Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms