Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FRAT1Q92837 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms