Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBM7

TMEM254, Transmembrane protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM254Q8TBM7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM254Q8TBM7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms