Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC50Q8IVM0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms