Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLNKQ7Z7G1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms