Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms