Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms