Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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