Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms