Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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