Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 LAMTOR1-204ENST00000538404 1346 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.464e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 COPZ1-214ENST00000552218 797 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.524e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAMTOR1-202ENST00000535107 619 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.524e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 USP10-215ENST00000569038 730 ntTSL 311.61□□□□□ -0.554e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 211.48□□□□□ -0.574e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.64e-6■■■□□ 14.8
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PCBP1Q15365 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.644e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.684e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 COPZ1-209ENST00000550171 1026 ntTSL 210.39□□□□□ -0.754e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAMTOR1-207ENST00000544594 849 ntTSL 39.81□□□□□ -0.844e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.844e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -14e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.324e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 NPEPPS-204ENST00000525037 1406 ntTSL 56.16□□□□□ -1.424e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 36□□□□□ -1.454e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 323.71■■□□□ 1.394e-6■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.27e-9■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.147e-9■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 515.64■□□□□ 0.097e-9■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.044e-6■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.272e-7■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.32e-7■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.192e-7■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TPTEP1-202ENST00000400593 1430 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-7■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)13.02□□□□□ -0.332e-7■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.54□□□□□ -1.362e-7■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.113e-18■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-18■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TUBB-207ENST00000396384 2823 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.733e-18■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.833e-18■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.115e-6■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.465e-6■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.435e-6■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.865e-6■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.485e-6■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.545e-6■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.555e-6■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 INSIG1-206ENST00000476756 1320 ntTSL 212.75□□□□□ -0.375e-11■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.352e-8■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.172e-8■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 CHP1-201ENST00000334660 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-7■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 VWCE-201ENST00000301770 3368 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.093e-10■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-10■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-10■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 CCNI-208ENST00000515468 636 ntTSL 35.77□□□□□ -1.494e-14■■■□□ 14.7
PCBP1Q15365 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 217.16■□□□□ 0.348e-7■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RTN3-211ENST00000542238 735 ntTSL 317.22■□□□□ 0.351e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RTN3-214ENST00000545432 545 ntTSL 416.5■□□□□ 0.231e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RTN3-212ENST00000543123 712 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RTN3-207ENST00000536011 992 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RTN3-213ENST00000543552 529 ntTSL 414.65□□□□□ -0.061e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RTN3-209ENST00000538995 814 ntTSL 212.9□□□□□ -0.341e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RTN3-201ENST00000338850 493 ntTSL 211.16□□□□□ -0.621e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ARHGAP11B-203ENST00000563110 2043 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.431e-13■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-13■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ARHGAP11B-206ENST00000566548 484 ntTSL 312.9□□□□□ -0.341e-13■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.645e-9■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-12■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.151e-12■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ILF2-204ENST00000480213 1008 ntTSL 58.18□□□□□ -1.11e-12■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 FAM193B-211ENST00000508298 479 ntTSL 520.77■□□□□ 0.921e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 FAM193B-210ENST00000507587 825 ntTSL 220■□□□□ 0.791e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)16.61■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.892e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.142e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.142e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.762e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.714e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 YWHAH-204ENST00000443669 822 ntTSL 325.46■■□□□ 1.674e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.674e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.612e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 224.7■■□□□ 1.544e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.492e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL14-204ENST00000435633 966 ntTSL 223.96■■□□□ 1.432e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.435e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL27-203ENST00000587478 584 ntTSL 223.75■■□□□ 1.392e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 USF2-216ENST00000607959 1920 ntTSL 523.69■■□□□ 1.382e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 223.47■■□□□ 1.354e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.345e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.292e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.282e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 MNT-204ENST00000572892 556 ntTSL 423.06■■□□□ 1.282e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.222e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.132e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PTBP1-209ENST00000586481 578 ntTSL 322■■□□□ 1.114e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.062e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.994e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TAGLN2-204ENST00000397334 801 ntTSL 520.6■□□□□ 0.898e-21■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-204ENST00000469443 653 ntTSL 220.31■□□□□ 0.842e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.794e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 USF2-213ENST00000600341 1392 ntTSL 219.84■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 14.6
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