Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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