Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMS2P3Q13401 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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