Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP1Q13363 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP1Q13363 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP1Q13363 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP1Q13363 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP1Q13363 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP1Q13363 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP1Q13363 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP1Q13363 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP1Q13363 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP1Q13363 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms