Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME3Q13232 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME3Q13232 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME3Q13232 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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