Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC16Q13042 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms